明朝末年，武当派数位高手相继遇害。时隔多年，凶手仍然是个谜。当昔日遗孤——当俗家弟子耿玉京已长成翩翩少年时，与前来比武的东方亮不打不相识，成为了无话不谈的挚友。倏忽间，风云再起，先是泰昌帝服用武当红丸后暴毙，后是新任武当掌门又对耿玉京步步相逼。无奈之下，耿玉京离开了武当山，在“独行大盗”郑铁岗和其孙女郑巧儿的帮助下，秘密追查当年父母遇害的真相……在追查事情的过程中，他又先后遇到了少林僧人慧可、断魂谷谷主卢象升、昆仑西门燕等武林人士，最后还与辽东的努尔哈赤成为了忘年之交。当调查逐渐有了指向，昔年隐藏的真相逐渐显露端倪时，耿玉京终于发现了努尔哈赤鲸吞中原的野心，而自己的父母当初便是因此而被害。带着国仇和家恨，耿玉京、东方亮一行回到了武当，自此埋藏多年的谜案终于揭晓，内奸也受到了应有的惩罚。
明朝末年，号称淑勒贝勒的努尔哈赤征服了建州五部，一面打击海西女真，一面全力进攻东海野人女真。此时的努尔哈赤表面归顺大明，向万历皇帝朝贡，宣誓效忠，暗地里却厉兵秣马，壮大势力。
耿京士不负众望取得比武大赛的胜利，他迫不及待想带着赏金离开。努尔哈赤却说自己是爱才之人，希望耿京士能够归顺于他，耿京士断然拒绝，称自己来比武只为赏金而来。
戈振军认定是耿京士杀害了何玉燕的父亲，耿京士称自己是被奸人所害，争吵之间两人打起来。何玉燕不相信耿京士会这样做，认为这中间一定是有什么误会。戈振军不听两人的解释，一剑杀了耿京士。
常五娘被戈振军拒绝，发誓要报复他，报复天下所有的男人。蓝玉京想跟着蓝水灵一起回神农架参加女儿会，蓝水灵说男孩不满十八岁不能参加。蓝水灵在女儿会上结识了外乡人郑巧儿。
蓝玉京打伤了寨主的弟弟，寨主带人登门兴师问罪。无相罚蓝玉京关禁闭窟三天三夜，寨主不同意，无相只好答应帮他的弟弟治伤，然后传授给他武当剑法，他才肯罢休。
无相狠狠教训了蓝玉京一顿，蓝玉京连连向不闻赔礼道歉，不闻不能说话，可他用手语为蓝玉京求情，无相还是决定惩罚蓝玉京，蓝玉京吓得连连求饶，无相才肯饶过他。戈振军罚蓝玉京不许吃饭，还要在饭堂门前倒立到天黑。