马云飞和高寒婚礼的当天，来了一个不速之客——“五号特工组”的老朋友老于，恳请他们再次出山，执行一项别人无法完成的任务：追查盗窃美国核武器资料的双料间谍吉川猛夫。为此，高寒做了落跑新娘，跟随欧阳剑平和李智博赶赴云南接受任务，马云飞和何坚也被迫出山，于是“五号特工组”五位成员：语言专家欧阳剑平、爆破专家李智博、特工马云飞、密码专家高寒、“神偷”何坚再次集结上了前线。同时，日本方面派出了他们的杀手锏，酒井朝香——她是酒井美惠子的亲妹妹，一个手腕更加毒辣凶狠的高级女间谍。 “五号特工组”出师不利，被吉川猛夫还没有暴露的同伙陷害入狱，五号无奈之下集体越狱……一面躲避美军的追捕，一面追击吉川猛夫，最终揪出了美军内部的叛徒，抢在酒井朝香之前找到了失窃的核武器资料。 战事愈演愈烈，前方战场的士兵出现了大规模病毒感染，五号特工组受命调查，路上和这场病毒站的祸首桥本失之...
1937年2月，纳粹德国在希特勒的批准下，启动“铀计划”，即大规模杀伤性武器，原子弹的研制工作。整个计划在实验初期，进展非常顺利，但最 终，由于制造反应堆的石墨纯度难以达标而受阻。几年后，美国利用从德
欧阳剑平、高寒和李智博赶往昆明。马云飞虽然嘴上没有答应老于，但还是担心高寒等人的安危。最终，马云飞和何坚做火车也赶往昆明帮助五特其他几 人。火车上，遇到美军滋事，马云飞英雄救美，结识了化装成女学生的女
双方一通激战，双方互有损伤，最危急时刻，马云飞与何坚赶到，击败了酒井等人，但同时，吉川也趁乱逃走。见到马云飞到来，高寒自然高兴，但不免对马云飞一阵奚落，马云飞一笑而过，大伙儿商量下一步的对策。同一时间
五特等人通过调查和分析，得出结论，整个资料被盗事件，很可能是在基地内部出了内奸，否则，日特不可能渗透进基地并取得资料。如果是这样，吉川在昆明的药店没有搞到消炎药品盘尼西林，很可能将通过基地的同伙，搞到
五特这边，准备先不点破魏明磊。既然知道了魏明磊是内奸，那么只要顺藤摸瓜，一定就可以找到吉川的下落。于是五特不露声色，开始悄悄跟踪魏明磊 的行踪，果然，几天后，众人确认了吉川的大致藏身地点。然而，就在五
魏明磊将五特抓捕后，立刻按照吉川的建议，用高寒的电台，给德国人发了一封电报，告诉德国人，自己手里有重要的原子弹资料，希望和德国人交易。 马云飞与何坚一筹莫展，这是老于赶到昆明。三人商议，由于各种证据都